在手術室凈化工程中，凈化空調的系統組成包括：醫用凈化空氣處理機及新風處理機組、凈化風管及閥門、水管閥門、送回風裝置、加濕系統。

為防止微生物二次污染，凈化空調機組表面和零部件需要選擇耐腐蝕的材質，材質表面要光潔，無劃痕，這樣可以減少塵埃的聚集。

為防止倒吸，需要在冷凝器冷凝水的出口安裝防倒吸裝置，冷凝管要和下水道分開連接。由于存水容器的水質容易變質滋生出細菌，所以加濕器部分適合采用蒸汽加濕器，進入加濕器的水應該符合生活用水標準，加濕器的材料要抗腐蝕的，方便清潔和檢查。

由于木質產品容易潮濕、掉屑凈化空調的高效過濾器不能用木框制品，使用風量低于額定風量的70%，當運行阻力達到運行初阻力的2倍時，

過濾器就需要及時更換了。過濾器前后設置壓差計，接管保持通暢、嚴密。

凈化空調的消聲部件不能選擇玻璃纖維及其制品，要選擇耐腐蝕、不積塵土的材質。

空調的風管采用鍍鋅鋼板加工，無氧化、不起殼、沒有銹蝕等。在安裝前，風閥、風口、消音器等零部件也要嚴密包裝存放在干燥區域。風閥和零件的表面要進行防腐處理，對暴露在循環空氣中的金屬部件，應該選擇防銹、耐腐蝕的。葉片也要選擇平滑無毛刺的。

空調系統對于手術室凈化作用重大，因此在選擇材料和部件時要特別注意。